由于聚丙烯酰胺大分子量上有许多的酰胺基团，在亲和、吸附作用下，使水体中胶体粒子之间“架桥”,从而使众多粒子连在一起，形成絮团，或下沉或上浮，最后与水分离。由此把聚丙烯酰胺用作絮凝剂，用以处理供水、饮用水、城市污水及工业废水。

非离子型聚丙烯酰胺由于不带离子型官能团，絮凝性能受水体pH值、盐类影响不大，但在酸性条件下由于阴离子型聚丙烯酰胺。

阴离子型聚丙烯酰胺适用于胶体粒子带正电荷的废水处理，一般分子量较高，适用水体pH值为中性到碱性。可用于炼铁高炉，铝加工，造纸及河沙洗涤等废水处理，也可用于城市污水的一级处理。

阳离子型聚丙烯酰胺分子量较低，主要用于絮凝带负电荷的胶体，具有除浊、脱色等功能，适用于染色、造纸、纸浆、食品、水产品加工与发酵等工业废水处理，以及城市废水污泥脱水处理。在絮凝处理过程中，根据欲处理水质有时需要加入一些助剂，如石灰、铝盐或铁盐，使絮凝效果更好。